TUGAS TERSTRUKTUR BIOLOGI MOLEKULER

coeats_granary@yahoo.com

 

 Kuat Prabawati

http://www.coe4t8.wordpress.com

fariz_dna06@yahoo.co.id

 

Nur Fariza

http://www.fariz06.wordpress.com

meyta_pe@yahoo.com 

Meyta Pratiwi

http://www.methonx.wordpress.com

AKTIVITAS DAN APLIKASI ENZIM PADA RISET DNA REKOMBINAN

Teknologi DNA rekombinan merupakan salah satu faktor yang berkontribusi dalam

perkembangan pengetahuan ekspresi gen. Teknologi DNA rekombinan pertama kali dilakukan

sekitar tahun 1970 – 1980-an. Dasar dari teknologi DNA rekombinan adalah manipulasi molekul

DNA dalam tabung uji. Teknik DNA rekombinan ini melibatkan enzim – enzim yang

aktivitasnya dapat diketahui dan dikontrol. Enzim – enzim tersebut terbagi dalam empat

golongan besar, yaitu :

1. DNA polimerase

Enzim yang mensintesis polinukleotida baru yang komplemen dengan DNA atau RNA

template.enzim ini digunakan dalam PCR, sekuensing DNA, pelabelan DNA dan riset –

riset biomol lain.

Ada 2 peran eksonuklese dari DNA polimerase yaitu :

a. Eksonuklese 3’-

 

5’: berfungsi menghilangkan nukleotida dari ujung 3’ pada untai

DNA yang baru disintesis aktivitasnya disebut

 

proofreading  karena eksonuklese

 

ini membiarkan DNA polimerase mengoreksi kesalahan insersi basa yang tidak

pada tempatnya.

b. Eksonuklease 5’ ke3

 

’: biasanya berfungsi pada replikasi DNA, yaitu untuk

menghilangkan sedikit bagian dari polinukleotida yang sudah disisipkan ke untai

template.

  

 

 

2. Nuklease

Enzim yang berfungsi untuk memutus ikatan fosfodiester yang menghubungkan

nukleotida yang satu dengan yang lain. Ada 3 macam nuklease :

a. Eksonuklease, menghilangkan nukleotida dari ujung molekul DNA atau RNA.

b. Endonuklease, aktivitasnya memotong ikatan fosfodiester internal.

c. Restriksi endonuklease, mempunyai peran khusus dalam teknologi DNA rekombinan,

yaitu dapat mengikat DNA pada urutan tertentu dan membuat untai ganda DNA

terpotong dalam urutan tertentu.

Gambar 2. Aktivitas enzim Nuklease

3. Ligase

Tahap penting dalam teknologi DNA rekombinan adalah penyambungan molekul DNA

asing ke DNA vektor. Proses ini disebut proses ligasi dan dikatalisis oleh enzim ligase.

Ligase adalah enzim yang berperan dalam menyambung ikatan kovalen antara gula dan

fosfat. Contoh enzim ligase: enzim ligase dari 

 

 E. coli dan faga T4. Ligase lebih efisien

menyambung ujung lengket (sticky end) dibandingkan menyambung ujung tumpul sebab

interaksi ikatan hidrogen antara tonjolan ujung lengket (sticky) menambah stabilitas

kedua untai ketika proses katalisis berlangsung; interaksi seperti itu tidak terjadi pada

proses ligase ujung tumpul (blunt end) sehingga proses ligasi menjadi tidak efisien. Hasil

reaksi ligasi antara vektor (plasmid) dan fragmen DNA setelah dipotong enzim restriksi

yang sama, sebagai berikut :

a. Vektor berhasil disisipi fragmen DNA asing bukan target

b. Vektor berhasil disispi fragmen DNA asing target

c. Vektor tidak berhasil disisipi dan menyambung kembali (religasi)

 

 

4. Enzim modifikasi akhir

Contoh dari enzim modifikasi akhir yaitu:

a. Terminal deoksinukleotidil transferase

Berfungsi untuk membentuk ujung DNA yang homopolimer

b. Alkaline fosfatase

Berfungsi untuk menghilangkan fosfat dari ujung 5’ pada molekul DNA yang

mencegah molekul ini berligasi

c. Polinukleotida kinase

Kebalikan dari alkaline fosfatase yaitu menmbahkan fosfat pada ujung 5’.

Daftar Pustaka:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?highlight=DNA%20polymerases,4.1.1.&rid=genom

es.section.5997#6011

Situs terkait:

 

http://www.molecular-plant-biotechnology.info/enzymes-used-in-geneticengineering/

enzymes-used-in-genetic-engineering.htm

 

http://www.studentsguide.in/microbiology/recombinant-dna-technology/recombinantdna-

technology-introduction.html

 

 

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.figgrp.6033

Situs gambar: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.figgrp.6002

FAKULTAS BIOLOGI

UNIVERSITAS JENDERAL SOEDIRMAN

PURWOKERTO

K31-TD-02

Oleh:

B1J006159

 http://www.chuq.qc.ca/labomoss/Protocols/Protocol%20DNA%20man%20lab.html

 http://www.jiskha.com/science/biology/DNA_manipulation.html

sebel

gimana ga sebel tugas bareng2 dikerjain sendiri, jangan lagi2 dech kerja bareng ma mereka…never again!!!!!

entah mencerca pa

kangen bwt dikangenin orang…when-when pasti da yang datang, aku akan good-good only, karena aku pasti bisa, tanpa masalah tentang cowo…padahal aku tanpa co tapi Masya Allah rasanya yang paling bermasalah dengan co dikelas cuma aku. aku akan good2 only seperti iklan 3 di tv, yang selalu bilang good2 only ditiap tayangnya. aku pasti bisa tanpa mal gizi, pa lagi mal cowo. ketika mereka melihat lampion yang tergantung pasti mereka bisa melihat dari berbagai sisi, sehingga mereka bener2 bisa menilai lampion itu bagus atau ga…begitu juga aku, suatu saat aku akan terlihat dari berbagai si2, sisi kepolosanku tentang cowo, kebusukanku tentang cowo, sisi humorku yg kadang jayus, sisi cantikku yg terpendam terlalu jauh, sisi biadabku yg bisa muncul kalau lagi BT, sisi munafikku kalau lg ngomongin cowo, sisi ankerku kalau lagi marah2, aku memang wanita penuh begitu sejuta pesona, tapi sayang terpendam khakkhahahaha,,,ukhhh. kapan2 aku bisa punya cowo…

padahal ide berlian temenku yg ngomong aku kudu pasang pengumuman pencarian cowo di blog wakh dah hampir tak lakuin…

 

aku memang multitalented dalam duniaku, dunia khayalku…

tetep ga tenang

alkhamdulillah kemarin cy emang flashku ga jadi di format, tak bawa ke dukun flashdisc langsung bner. sia-sia dech air mata kemarin tu..

hari ni ko’ daku ngrasa daku bukan po2 ya…sempet buk2 fs temennya temen jadi ngrasa kerdil nih jiwa raga. mreka dah nyampe mesir, malaysia bukan jadi TKI tapi jadi mahasiswa, daku po,,,,,Karangwangkal ja dah sangat amat patut di syukuri lho. mreka emang beruntung..ga tahu mpe sekarang mreka nyadar ga ya.

hati tetep ga tenang satu minggu lagi ujian sisipan, daku kudu extra ni tugas blon tak kerjain. dakunya masih nyante. padahal habis usip daku kayanya lebih extra large lg sibuknya,,,,bukan cuma film yg XL dunk…temen jaman SMA dah da yg cumlaude daku masih biasa ja. padahal temen daku tu boleh dibilang dulu biasa ja. tapi, kayanya kalo yg ni bukan keberuntungan. hekhhhh, daku syukuri ja dech ga tahu mau jadi pa besok yg penting hari ni masih bisa makan masih bisa tidur masih bisa baca buku masih bisa normal masih bisa ketawa masih bisa ngenet masih bisa nafas tuh yang penting masih bisa ngaca ma temen2 yg dah sukses dari sisi pendidikan, uang, kecantikan, jodoh…tahu akhhhh ga tahu dech kalau di ranking dari semua temen yg daku kenal dari berbagai kategori itu daku urutan yg keberapa.

intinya, meski

belon ke Mesir, belon ke Malaysa, belon bisa bahasa arab to inggris, belon bisa punya gebetan to pacar, belon bisa cumlaude, belon bisa cantik banget, tapi daku beruntung punya orang tua yang bisa nrima daku apa adanya. punya temen yg kadang lebih mempercayakan beberapa hal tentang urusan kul ke daku, beruntung punya hati yg bisa ngaca ma orang lain yg jauh lebih baik. keep spirit Wat, hari masih puanjang, minggu masih di ufuk timur, bulan masih di pangkal pagi, tahun masih menanti untuk lebih baik lagi…Amien.

BT..BT…

Tragis banget data-data, laporan2, tugas2, jurnal2 semua hilang tak berbekas dalam flashku

aku kacau banget kemarin..terkapar, pengin nangis, tapi sepertinya air pun enggan keluar karena aku ingin yang lebih heboh dari itu. ingin teriak takut disangka gila, pengin tidur pikiran nyiksa, pengin curhat ga bakal ada yang tahu, pengin ngeluh ga da waktu. yang bisa aku lakuin adalah kembali mengerjakannya lagi…do..do and do. Untung temenku langsung minjemin flash, aku mulai tenang. mulai mencari data, jurnal, ngerjain lap lagi…semua butuh pengorbanan,,,sabar-sabar. ayo cemyangatzz…..hari masih puanjang…

Cinta yang Kehilangan Arah

Ketika hati ini begitu rapuh

Semua seolah akan runtuh

Aku terjebak dalam prinsip hidup kaku yang kubuat

Rasionalitas, logika, sistematika yang tanpa kusadari semua begitu menyiksa

Terkadang cinta tak butuh logika

Hati kecil lirih berbisik

Cinta yang tumbuh beriringan dengan logika itu obsesi

Cinta yang tumbuh beriringan dengan keikhlasan itu cinta setulus hati

Dan cinta pada Rabb kita itulah cinta sejati

Cinta pada dia manusia yang terkadang tersakiti benar-benar sampai ke ulu hati

Cinta pada dia Rabb kita Yang Maha Memberi terkadang ternafikan tanpa kita sadari

Lama ku terpapar dalam lamunan yang menjenuhkan

Aku tak mau menjadi Kaum tengah yang kehilangan arah, terkadang berbalut religius, terkadang berbalut misterius

Cinta apakah yang ku punya untuk-Nya

Cintakah yang ku punya atau nafsukah untuk si dia manusia

Inginku lanjutkan cintaku ke dia, tapi aku teringat cinta-Nya

Aku teringat Dia yang mudah cemburu pada hamba-Nya

Mudahkah aku lepas begitu saja

Hanya untuk mencari ridho-Nya

Entahlah aku bingung….

Harapanku semoga si dia manusai datang tepat pada waktunya…, Amin.