aku di Bogor

udah mo dua minggu di sini…minggu pertama boleh dibilang cuma persiapan. minggu ke dua mungkin dah mulai kerja,,,tapi aku kecewa hiks..hiks…alatnya terbatas jadi yg kerja gantian dech…hwuuuufffff…kpaan selesai ya….semoga Alloh selalu ngasih aku semangat..amien.

masih dengan surprise dari Alloh aku ditawarin jadi asisten Biomol ma Pak hendro…waahahahaahahahahah rasanya aku kaget, seneng, tapi juga lumayan was2 coz berarti kerjaan semester6 ini tambah banyak…dan kesempatan bwt ambil SKS full ga tahu ni…tapi kapan lagi aku ditawarin jadi asisten cuma2…Alkhamdulillah hirobbil’alamin.

aku harap semua yg diberikan ini, aku bisa menghandlenya…amin..dan semoga bapak bisa pengertian dg memberi fasilitas lebih ke aku..dan Alloh menolong untuk membantunya..Amin.

cihuiyyyy…berangkat

Alkhamdulillah…hari ni aku Insya alloh pergi ke Bogor. terima kasih ROBB untuk kesempatannya…semoga semua baik2 ja…dan aku berharap semua mimpi yg dah terwujud akan membuatku semakin semanagat…amin…

aku PKL..lllllll……….ZZZZZzzzz…..

akhirnya aku PKL, semoga di LIPI nanti aku bisa tenang ga mikir yg ga2..aku bisa memikirkan obsesi2ku selama ini, melanjutkannya menjadi hal yg bukan mimpi. aku bersyukur aku masih bisa menghirup udara hari ni, setelah semua masalah yg ada…ujian belum kelar,,,aku baru ngajuin surat permohonan pembimbing hari ni ke komisi, moga siang ni dah keluar.
tanggal 19 besok aku berangkat ke BOGOR bwt PKL, ga nyangka ternyata 3 th dah berlalu…..hampir kelar, masih 1,5 mpe 2 th lagi aku di sini…aku kudu menikmati semua yga da. tanpa cowo,,aku harus kuat, aku ga boleh mengecewakan ortuku.
hal yg paling berkesan disemester ini, Alkhamdulillah hampir semua keinginanku tercapai di sem ini,program sem 3 akhirnya tercapai setelah satu th…awal th 2009 mungkin ak kehilangan teman. tapi aku mendapatkan apa yg ku butuhkan…aku bisa ngasistenin, dari itu aku bisa ngedapetin uang sendiri, kacamata dah diganti setelah 4 th make itu….nilai yg jelek dah diperbaiki ga tanggung2 aku dapet A, semoga nilai yg lain ga bikin masalah baru,,,Amin. Terima kasih Rabb semoga kegemilangan ini ga bikin aku puas begitu ja, tapi juga ga bikin aku malah tambah down karna melihat yg lebih tinggi dariku,,,semoga semua bisa menjadi pelajaran buatku…meski dalam hal cinta ku selalu belum beruntung..hehehhe

kemarin hari yang aneh

aku bete banget kemarin, kebetulan kemarin presentasi bakteriologi di kelas. kelompok kami kebagian isolasi dan pertumbuhan bakteri. kita dah nyari materi mpe ke warnet2 segala, buka2 blog orang, browsing dari subuh mpe siangan dikit, ngerjain dari malem mpe siang lagi. tapi, emang kata dosennya materinya kurang lengkap dan banyak yang salah karena ga sesuai!!!!!!selama presentasi, aku berfikir apa yg dikatakan dosen tidaklah selalu benar, ketika dosen mengatakan ini salah, itu salah maka yg keluar dari otakku adalah kebenaran hanya milik Allah. tapi kadang lebih sadisnya lagi aku berfikir dosen pun kayaknya salah, karena aku ngambil ga dari satu referensi. dia mengatakan ini salah dan itu salah hanya dari perspektif dia ja..ga dari kebenaran mutlak, karena pada dasarnya dalam Al Qur’an pun ga tertulis secara langsung pengertian2 ataupun etimologi2 bidang ilmu yg dipelajari, so bwt pa bilang ini salah itu salah…sebijaknya adalah kurang tepat atau mungkin lebih tepatnya…(mf karena aku masih kurang bisa menerima dg semua itu).

 

dan yang lebih parahnya lagi kita dibabat abis ma anak2 di kelas n dosen, bwt pa nanya kalo jawabannya mereka sendiri aja tahu, cuma bwt ngetes kita dg nada melecehkan?hhhhhehhh dasar mahasiswa konyollll…aku yg nyadar banget kalo itu proses intimidasi langsung gerah dunk…emang aku ketauan banget dari semua anak di dalam kelompok aku yg keliatan paling sewot, katanya keliatan pas njawab pertanyaan2 yang ku pikir mereka sendiri tahu jawabannya. belum lagi dosennya yg kadang slisih pendapat ma aku.

paling bete kalau lagi debat ma dosennya, bikin aku tambah ill feel karena statusku masih mahasiswa yg nyari referensi ga dari satu sumber, kalo dosenkan bisa dapet dari buku mereka..sementara buku mereka ja dipinjemin kagak boleh. walhasil nilai kel kita dapet yg paling rendah emang masih di atas 7 tapi tu cukup bikin syok anggota kel kita, senyuman2 sinis keluar dari beberapa temen kelas. aku sama sekali GA PERDULI dengan semua itu…aku yakin jauh dari dalam lubuk hati mereka melihatku adalah seorang yg ga gampang buat di pandang kaya ikan asin…mereka belum tahu aja, meski ikan asin banyak yg berfikir adalah ikannya orang miskin (kalo di sini disamain dg otaknya orang bodoh), tapi manfaatnya luar biasa karna kandungan gizinya cukup kumplit.

MAAF aku bukan orang yg menyerah pada keadaan begitu saja (kalo lg ga malez), pa lg kalo dah di pandang sebelah mata. mereka hanya melihat hasil…bukan proses yg kita jalani..whatever everything it’s okey, aku jadi belajar sabar…sama kaya temen yg disebelahku saat presentasi dengan menuliskan pada kertas seolah memberi kekuatan padaku dengan tulisan “sabar wat, tinggal beberapa menit lagi”, begitu juga lewat katanya, “sabar wat”…sama kaya kata2 firman malem kemarin “sabar wat, namanya juga perjuangan.

pengakuan dosa

Aku sekarang sedang tenang, mencoba melihat kembali ke belakang, aku malu banget. aku seperti wanita penggoda yang tak tahu diri, aku menelfon teman yang lama dah ku tahu dia punya temen deket, aku sms manja ke temen yang lama jadi sahabat karibku. Ya Allah, hanya engkau yang mampu memaafkan hamba yang hina ini. aku ingin banget berubah ke sisi masa laluku yg jelas membuat perubahan ke arah kebaikan.

aku yang dulu Ghadul bashor, aku yang dulu tak berani miscall ke orang yg ku anggap lebih, aku yg dulu sibuk dg obsesi2ku, aku yg dulu lebih pasrah, khusyu dalam menghadap ke Dia. Rabb, terimakasih untuk semuanya, untuk waktu kuliahku, untuk rizkimu, hidayahmu, kasih sayang yg tak henti diberikan kepadaku lewat orang2 yg deka, semoga mereka juga diberi hidayah-Mu Amin. aku merasa aku bukan pa2 tanpamu Rabb, maafkan hamba yang lalai selama ini dari kekhusyukan, maafkan hamba yg selama ini beribadah hanya untuk formalitas, lebih mengejar duniaku daripada akhiratku, lebih mementingkan sesuatu, yg jelas2 Engkaulah yang menguasai segalanya..tapi hamba malah berpaling dari Mu. hamba harap engkau senantiasa mengingatkan hamba Rabb tentang hidup ini agar hamba bisa bertemu dengan-Mu dalam keadaan mulia, AMIN YA RABBAl’ALAMIN.

lagu favorit

lagu favorit yg sekarang lg hit siy banyak, tapi yg kena dihati sesuai mood doank. da sheila on 7 dg yang terlewatkan, da hijau daun dengan suara, da cafein yg terdalam, d’ masiv diam tanpa kata, semua emang ngegambarin kisahku dan dia. tapi, biar dech aku yg tahu feel nya lo lg denger lagu2 tu.

ni lagu petikannya shelia on 7 yang judulnya  “Yang Terlewatkan”.

“……………………………

sesal takkan ada arti karena semua telah terjadi

kini kau telah menjalani sisa hidup dengannya

mungkin salahku melewatkanmu, tak mencarimu, sepenuh hati

maafkan aku…

kesalahanku melewatkanmu hingga kau kini dengan yang lain

maafkan aku…

mungkin aku terlambat, tapi kau tetap yang terhebat

melihatmu…

mendengarmu…

kaulah yang terhebat”

semua memang bwt dia, sejauh ini belum tergantikan dg yang lain. meski dia mungkin memang tak tahu.

soulmate 4 tahun tetap bersemi

ujian tengah semester sedang berlangsung, cowo belum dapet. tenang sie, coz cowokan bukan deadline…tapi ga tahu ya meski beberapa kali mencoba mencari yang lain untuk mengganti yang sejati, tapi akhir2nya aku tetep kepikiran dia. dia yang hampir 4 th lebih belum pernah ku temui. tapi sungguh, entah kenapa aku selalu yakin ada waktu untuk bertemu dengan dia meski cuma sekali, tapi yang ku minta adalah sebelum dia menikah dengan yang lain. agar aku tahu dia yang sebenarnya, dia yang dulu aku kenal, meski mungkin tak seperti dulu yang bisa memberikan inspirasi dalam segala hal.

laki2 kadang lebih busuk dari buah yang busuk, tapi entah kenapa kadang aku merasa tenang ketika ngobrol dengan laki2. tapi aku lebih tenang ketika memikirkan dia, laki2 yang mungkin biasa untuk sebagian orang tapi untukku luar biasa..bisa membuatku tiba2 meneteskan air mata tanpa sebab, bisa membuatku tenang ketika aku memikirkan banyak masalah, padahal hanya dengan memikirkannya..bisa membuat aku merasa bahwa dia tujuan hidupku. meski dia semu, meski dia belum pernah ku temui, meski dia menafikanku, meski dia mungkin ditakdirkan untuk yang lain, dan mungkin meski dia tak menyadari aku di sini selalu ada untuknya, meski di sms2 ku aku bisa biasa, seolah tak lagi ada rasa itu, tapi sungguh gejolak itu selalu muncul tiba2 disaat aku sendiri, disaat beban hidup kadang berada semua dipunggung, tapi hanya dengan memikirkannya aku kadang tenang…

apa dia tahu kalau aku adalah wanita yang selama mengenalnya tanpa menyadari diriku sendiri aku telah terperangkap dalam kasih sayang yang memilukan, kasih sayang yang mungkin sampai saat ini hanya aku rasakan ke dia, ga untuk yang lain. dia begitu sempurna di mataku. membuatku semakin berfikir aku merelakan mengabdikan sisa waktuku dengannya. tapi ini hanya mimpiku, hanya khayalan yang kadang semu. dia lebih pantas dengan yang lain, yang lebih dari aku. mas kapan kamu tahu aku masih menunggu saat2 kita bisa berbincang meski hanya dengan beberapa kata…

kapan kamu menyadari ada pengagum rahasia yang tak pernah henti selama mengenalmu, 4 tahun berlalu kamu seperti apa, bedakah dengan dulu awal ketika kita baru kenal. maaf foto2mu aku bakar. tapi wajahmu masih di hatiku yang terdalam, yang bisa membuat aku selalu ingat akan kamu ketika memikirkan laki2 lain. aku harap jika memang bukan kamu, Allah bisa memberikan yang “terbaik untukku dari sekedar kau”..itu sms yang pernah kamu berikan ke aku untuk mendoakan aku.

aku akan selalu menunggu waktu itu…

TUGAS TERSTRUKTUR BIOLOGI MOLEKULER

coeats_granary@yahoo.com

 

 Kuat Prabawati

http://www.coe4t8.wordpress.com

fariz_dna06@yahoo.co.id

 

Nur Fariza

http://www.fariz06.wordpress.com

meyta_pe@yahoo.com 

Meyta Pratiwi

http://www.methonx.wordpress.com

AKTIVITAS DAN APLIKASI ENZIM PADA RISET DNA REKOMBINAN

Teknologi DNA rekombinan merupakan salah satu faktor yang berkontribusi dalam

perkembangan pengetahuan ekspresi gen. Teknologi DNA rekombinan pertama kali dilakukan

sekitar tahun 1970 – 1980-an. Dasar dari teknologi DNA rekombinan adalah manipulasi molekul

DNA dalam tabung uji. Teknik DNA rekombinan ini melibatkan enzim – enzim yang

aktivitasnya dapat diketahui dan dikontrol. Enzim – enzim tersebut terbagi dalam empat

golongan besar, yaitu :

1. DNA polimerase

Enzim yang mensintesis polinukleotida baru yang komplemen dengan DNA atau RNA

template.enzim ini digunakan dalam PCR, sekuensing DNA, pelabelan DNA dan riset –

riset biomol lain.

Ada 2 peran eksonuklese dari DNA polimerase yaitu :

a. Eksonuklese 3’-

 

5’: berfungsi menghilangkan nukleotida dari ujung 3’ pada untai

DNA yang baru disintesis aktivitasnya disebut

 

proofreading  karena eksonuklese

 

ini membiarkan DNA polimerase mengoreksi kesalahan insersi basa yang tidak

pada tempatnya.

b. Eksonuklease 5’ ke3

 

’: biasanya berfungsi pada replikasi DNA, yaitu untuk

menghilangkan sedikit bagian dari polinukleotida yang sudah disisipkan ke untai

template.

  

 

 

2. Nuklease

Enzim yang berfungsi untuk memutus ikatan fosfodiester yang menghubungkan

nukleotida yang satu dengan yang lain. Ada 3 macam nuklease :

a. Eksonuklease, menghilangkan nukleotida dari ujung molekul DNA atau RNA.

b. Endonuklease, aktivitasnya memotong ikatan fosfodiester internal.

c. Restriksi endonuklease, mempunyai peran khusus dalam teknologi DNA rekombinan,

yaitu dapat mengikat DNA pada urutan tertentu dan membuat untai ganda DNA

terpotong dalam urutan tertentu.

Gambar 2. Aktivitas enzim Nuklease

3. Ligase

Tahap penting dalam teknologi DNA rekombinan adalah penyambungan molekul DNA

asing ke DNA vektor. Proses ini disebut proses ligasi dan dikatalisis oleh enzim ligase.

Ligase adalah enzim yang berperan dalam menyambung ikatan kovalen antara gula dan

fosfat. Contoh enzim ligase: enzim ligase dari 

 

 E. coli dan faga T4. Ligase lebih efisien

menyambung ujung lengket (sticky end) dibandingkan menyambung ujung tumpul sebab

interaksi ikatan hidrogen antara tonjolan ujung lengket (sticky) menambah stabilitas

kedua untai ketika proses katalisis berlangsung; interaksi seperti itu tidak terjadi pada

proses ligase ujung tumpul (blunt end) sehingga proses ligasi menjadi tidak efisien. Hasil

reaksi ligasi antara vektor (plasmid) dan fragmen DNA setelah dipotong enzim restriksi

yang sama, sebagai berikut :

a. Vektor berhasil disisipi fragmen DNA asing bukan target

b. Vektor berhasil disispi fragmen DNA asing target

c. Vektor tidak berhasil disisipi dan menyambung kembali (religasi)

 

 

4. Enzim modifikasi akhir

Contoh dari enzim modifikasi akhir yaitu:

a. Terminal deoksinukleotidil transferase

Berfungsi untuk membentuk ujung DNA yang homopolimer

b. Alkaline fosfatase

Berfungsi untuk menghilangkan fosfat dari ujung 5’ pada molekul DNA yang

mencegah molekul ini berligasi

c. Polinukleotida kinase

Kebalikan dari alkaline fosfatase yaitu menmbahkan fosfat pada ujung 5’.

Daftar Pustaka:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?highlight=DNA%20polymerases,4.1.1.&rid=genom

es.section.5997#6011

Situs terkait:

 

http://www.molecular-plant-biotechnology.info/enzymes-used-in-geneticengineering/

enzymes-used-in-genetic-engineering.htm

 

http://www.studentsguide.in/microbiology/recombinant-dna-technology/recombinantdna-

technology-introduction.html

 

 

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.figgrp.6033

Situs gambar: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.figgrp.6002

FAKULTAS BIOLOGI

UNIVERSITAS JENDERAL SOEDIRMAN

PURWOKERTO

K31-TD-02

Oleh:

B1J006159

 http://www.chuq.qc.ca/labomoss/Protocols/Protocol%20DNA%20man%20lab.html

 http://www.jiskha.com/science/biology/DNA_manipulation.html

sebel

gimana ga sebel tugas bareng2 dikerjain sendiri, jangan lagi2 dech kerja bareng ma mereka…never again!!!!!

entah mencerca pa

kangen bwt dikangenin orang…when-when pasti da yang datang, aku akan good-good only, karena aku pasti bisa, tanpa masalah tentang cowo…padahal aku tanpa co tapi Masya Allah rasanya yang paling bermasalah dengan co dikelas cuma aku. aku akan good2 only seperti iklan 3 di tv, yang selalu bilang good2 only ditiap tayangnya. aku pasti bisa tanpa mal gizi, pa lagi mal cowo. ketika mereka melihat lampion yang tergantung pasti mereka bisa melihat dari berbagai sisi, sehingga mereka bener2 bisa menilai lampion itu bagus atau ga…begitu juga aku, suatu saat aku akan terlihat dari berbagai si2, sisi kepolosanku tentang cowo, kebusukanku tentang cowo, sisi humorku yg kadang jayus, sisi cantikku yg terpendam terlalu jauh, sisi biadabku yg bisa muncul kalau lagi BT, sisi munafikku kalau lg ngomongin cowo, sisi ankerku kalau lagi marah2, aku memang wanita penuh begitu sejuta pesona, tapi sayang terpendam khakkhahahaha,,,ukhhh. kapan2 aku bisa punya cowo…

padahal ide berlian temenku yg ngomong aku kudu pasang pengumuman pencarian cowo di blog wakh dah hampir tak lakuin…

 

aku memang multitalented dalam duniaku, dunia khayalku…